末班车和首班车
大多数线路从市中心发出的末班车（終電）大约在零点到零点半之间，但这只是某一条线的末班车，不一定是你能到家的最后一班。如果要换乘或者回郊外，最后一班接驳车可能远早于零点就开走了。周末和节假日时刻表略有不同，而倒数第二班车通常比最后一班空得多。
路线要在傍晚就查好，别等到了闸机口才看。Jorudan的Japan Transit Planner和NAVITIME都有英文路线查询，能显示末班车和首班车，Google地图也能查到列车时间。首班车（始発）大约从早上5点开始运行。大型演唱会或烟花大会散场后，光是挤进最近的车站就可能要半小时以上，留出余量，或者走到下一站去坐。
- 吃晚饭时先查一次末班车，在发车前20分钟设个提醒。
- 末班车过后车站会拉下卷帘门关闭，没法在站里等到天亮。
出租车和打车应用
出租车通宵运营，干净又安全。晚上10点到早上5点，计价器会加收20%的深夜费。末班车刚走时，涩谷、新宿、六本木的出租车站会排起长队，路边也很难拦到车，这时打车应用就很管用。日本使用最广的打车应用是GO，有英文界面，也能用境外手机号注册，会在计价器金额之外加收少量叫车费。Uber在东京也能用，派的是正规出租车，已经有账号的话很方便。
以前末班车之后，新宿、涩谷等枢纽站有很多开往郊外的深夜急行巴士（深夜急行バス），但疫情期间大部分线路停运，现在只剩少数几条，主要服务通勤族。去郊外的长途车程加上深夜费涨得很快，所以常常更划算的做法是先打车到附近的酒店、卡拉OK或胶囊旅馆，再坐首班车回去。后车门是自动开关的。大多数出租车能刷信用卡和IC卡，不过身上带点现金总没错。
- GO和Uber下单前会显示预估车费，可以和胶囊旅馆的价格比一比。
- 三四个人同路的话，拼一辆车分摊下来通常不算贵。
错过末班车？能待到天亮的地方
错过末班车在东京本地人里也很常见，消磨到天亮的办法早就很成熟。大车站附近的连锁卡拉OK有到早上的深夜套餐，独立包间温暖又安全，和朋友一起或一个人都行。网吧和漫画咖啡馆（ネットカフェ、漫画喫茶）有夜间套餐，小隔间里有的能平躺，很多店还有免费饮料和淋浴。记得带护照：按东京的规定，入店时要查验带照片的证件。
新宿、涩谷、上野等大车站周边的胶囊旅馆接受深夜入住，不少只接待男性，或设有女性专用楼层，去之前先确认。大部分连锁家庭餐厅这几年取消了24小时营业，不过便利店通宵开着，车站附近很多牛肉饭连锁店也营业到天亮，想吃口热饭没问题。
- 在地图应用里搜车站附近的「ネットカフェ」或「カラオケ」，它们多在站前大楼的楼上。
- 周五周六晚上胶囊旅馆容易满，末班车开走前就用手机订好。
通宵进行的活动
有些夜晚本来就是为了玩到首班车。2016年法律修改后，取得许可的俱乐部可以在午夜后继续营业，涩谷、新宿、六本木的很多俱乐部派对会一直开到首班车前后。必须年满20岁，门口会查带照片的证件，记得带护照。一些电影院会办通宵放映（オールナイト上映），连续放好几部片，动漫和音乐活动有时也有通宵场。
跨年夜是唯一有通宵电车的晚上：近几年JR东日本会在山手线等几条主要线路通宵运行，东京Metro则没有。具体安排每年12月公布。跨年演唱会和派对通常在普通末班车之后才结束，记得看活动页面的结束时间和铁路公司的通宵运行公告。
深夜安全
东京是世界上夜间最安全的大城市之一，凌晨在街上走很正常。需要留心的主要是新宿歌舞伎町、六本木这类夜生活区。别理会街头拉客的人，绝不要跟着别人去他推荐的酒吧，点单前先看价目表和入场费，饮料不要离开视线。觉得不对劲就去交番（派出所）或拨打110。
一个人的时候，把回去的路线发给朋友，手机保持有电，便利店能买到充电宝。大部分地方在街上喝酒并不违法，但有些区在热闹地段禁止路上饮酒：涩谷站周边从2024年10月起每天18点到次日5点禁止，新宿在万圣节期间也有规定，警察会执法。
